Swedavias miljöstrategi innebär att arbeta för ständiga förbättringar på miljöområdet genom att integrera miljöfrågorna i all verksamhet och strukturera arbetet med miljöledningssystem uppbyggda enligt kraven i standarden ISO 14001.

Flygplatserna i Umeå, Göteborg och Malmö liksom Teknik är miljöcertifierade enligt ISO 14001. Övergången från 22 miljöledningssystem till ett gemensamt genomfördes vid årsskiftet 2007/2008. Det gemensamma systemet är webbaserat och innehåller bl a gemensamma rutiner. Där lokala rutiner behövs finns detta dokumenterat vid varje enskild flygplats/enhet.

Swedavias 13 flygplatser är tillståndspliktiga enligt miljöbalken. Miljörapporter med miljödata och uppgift om miljöarbetet lämnas varje år till respektive tillsynsmyndighet.

På Swedavias flygplatser tillämpas miljörelaterade avgifter. Det innebär att de flygplan som bullrar mest eller släpper ut mest avgaser får betala högst miljörelaterad avgift.